継桜王子境内に10本近くある老杉の巨木は熊野那智大社に向けて南向きに枝を伸ばします。

熊野古道の往時の面影が残る大門坂の入り口に、樹齢800年といわれる夫婦杉がそびえます。

熊野本宮大社、熊野那智大社と並ぶ熊野三山の一つ。推定樹齢800年のナギの巨木はご神木で、海上保安や縁結びの木として信仰され、国の天然記念物に指定されています。

笠田小学校となりの大樹は幹周り13m、高さ20m、樹齢600年で近畿最大のクスの木です。5月頃、黄白色の小花が見られます。（県指定天然記念物）

万葉の時代、斎明天皇が創建したと伝えられ、境内を樹齢約1000年の大楠がおおいます。（県指定天然記念物）

黒竹は淡竹（ハチク）の一種で1〜2年を経るうちに黒茶色になるのが特徴です。日高町は全国一の黒竹の生産地で、熊野古道の道沿いに見られます。

幹周り5.6m、高さ20m、樹齢600年の銘木。新日本の銘木百選に選ばれています。（県指定天然記念物）

本堂へ上る10m程の石段の上り口左側に、胸高幹周り4.32m、高さ20m余りもの1株、石段の上右側に胸高幹周り7.03m、高さ23m余りもの1株があり、いずれも樹齢800年余りと推定されるカヤの大樹があります。かつては高野詣の休憩所としても人々の心を癒しました。（県指定天然記念物）

石の鳥居の北側に立つ高さ25m、本幹の周囲5mあまりの老大木。本幹の根元にクロガネモチの壮齢樹が抱合される県の天然記念物です。

平安時代初期（859年）ウバメガシ数百本が植栽されたとあり、樹齢1100年以上と推定されるウバメガシの老樹2株が現存します。またウバメガシは県の特産品「紀州備長炭」の原木で、県の木になっています。（県指定天然記念物）